内镜中心目前共有研究生导师8人（其中博导4人），在培研究生20余名。科室每年培养近150名国内进修人员。近5年，内镜中心培训国外进修医生137人，学员来自世界各地知名大学医院。中心每年举办“上海国际消化内镜研讨会”（SIES）一次，近2年每年参会代表超过3000名，至今已累计举办13届；中心每年举办5-6期内镜微创切除新技术学习班，至今已累计举办50期，培训学员超过2000名。中心还每年举办1期国家级继续教育培训班、1届胃放大内镜研讨会、1届中山内镜论坛和1届静脉曲张研讨会，定期举办ERCP、EUS、小肠镜和放大内镜手把手培训班。